Jėzuitiškojo Vilniaus universiteto (1579–1773 m.) absolventų tezės ir kiti mokslo darbai, skirti viešam disputui arba mokslo laipsniui įgyti.
Lietuvos Didžiosios Kunigaikštystės unitų, arba graikų apeigų katalikų, Bažnyčios dokumentai saugomi Vilniaus universiteto bibliotekoje.
Tarptautinio projekto EODOPEN (eBooks-On-Demand-Network Opening Publications for European Netizens) metu suskaitmeninti ir atverti leidiniai.
Lietuvos Didžiosios Kunigaikštystės (LDK) teismų knygos – vienas įdomiausių Vilniaus universiteto bibliotekos istorinių rinkinių. Jį sudaro beveik šeši šimtai 1540–1845 m. rankraštinių aktų knygų ir jų fragmentų. Teismų knygų turinys atspindi plačią politinę, juridinę, socialinę ir ekonominę Lietuvos istorijos panoramą, praeities buitį, visuomeninę bei individualią psichologiją.
Vilniaus universiteto profesoriaus Joachimo Lelevelio (1786–1861) asmeninė biblioteka, testamentu paskirta universiteto bibliotekai.
VU biblioteka, saugodama ne vieną unikalų lietuvių raštijos paminklą, įsijungė į UNESCO „Pasaulio atminties“ programą 2006 metais ir į registrą jau pateikė kelias dešimtis vertingiausių nacionalinės bei regioninės reikšmės objektų.
Rankraščiai ir spausdinti dokumentai, parodantys lietuviškų raštų raidą nuo seniausių knygų lietuvių kalba – Martyno Mažvydo ir Mikalojaus Daukšos „Katekizmų“ – iki XX a. lietuvių literatūros klasikų.
Vilniaus universiteto istorijai pažinti svarbūs dokumentai, liudijantys universiteto įkūrimą, mokymo ir mokymosi procesų raidą, profesorių ir studentų akademinio ir kasdienio gyvenimo ypatumus, sukurtų veikalų įtaką valstybės kultūrai ir mokslui.
Vilniaus universiteto bibliotekos kartografijos kolekcija yra ne tik pati turtingiausia Lietuvoje, bet ir viena įdomiausių Rytų Europoje. Rinkinį sudaro atlasai, istoriniai žemėlapiai ir rankraštiniai žemių planai bei brėžiniai.
Įvairūs rankraštiniai dokumentai atskleidžia žinomų Lietuvos Didžiosios Kunigaikštystės kunigaikščių bei didikų giminių istorijos ištakas, parodo Lietuvos aukštuomenės įsiliejimą į Europos kilmingųjų šeimą.